2014年2月28日

【Presentation】簡報前要寫稿

如果以為用英文進行簡報時,只要前幾天稍做準備一下就上台,要不是你的英文特別好,不然是絕對講得特別爛,像我個人就很討厭參加自己實驗室的meeting,去年度只去過兩次,也就是我報告的那兩次,因為,我覺得很多人都沒把簡報當一回事,只是敷衍一下老闆用的,英文爛就算了,稿子也沒背熟,當然就不要說整個流程真的是讓沒有從事相關研究的人完全聽不懂重點。

像我個人會提早一個月開始設計投影片,並為其寫好講稿,然後還要再花一到兩個星期的時間去背稿跟調整語氣,因為我的口音也不是很道地的美國腔,但至少我會努力得很像一回事,以下就是2014年2月12日的進度報告英文講稿,裡面也許很多文法錯誤,這也不重要了,重要的是我可能當年在學校成績比不上人,但離開學校後,很多人做不好的事,我都會做得很好,這樣就贏了。
Good morning, I would like to say thank you for joining this meeting, this is my progress report, and my title is "Modification of the head group based on the structure of C34."
In the first slide, I would like to give you a brief introduction about this project. Basically, I am trying to create many glycolipid antigens that look like this compound, α-galactosylceramide, which is also known as α-GalCer or KRN7000, and here in this building, we’re calling it C1.
When this compound is injected into mice, it binds to CD1d protein as a binery complex, which is presented on the cell surface of antigen presenting cells, such as macrophages or dendritic cells.
Unlike any other conventional T cells, NKT cells don't interact with peptide antigens, it will specifically recognize this binery complex. After that, both NKT and APC will release many Th1 and Th2 cytokines, such as IFN-γ and IL-4 to further promote Th1 or Th2 responses.
And we know that Th2 cytokines will suppress Th1 responses. So in our case, if we wish to induce Th1-biased responses for anticancer treatments, we certainly hope that more IFN-γ could be released during the process.
Here we can see that, when NKT cells make contact with α-GalCer, IL-4 is released within 2 hours, followed by the production of large amount of IFN-γ. And based on what we have learned about so far, α-GalCer may sometimes induce Th2 responses instead of Th1 in some cases, which means it is not really good enough for inducing Th1-biased responses, that’s why we’re working so hard on the improvement of its reactivities.
After years of research, we have created these phenyl-containing glycolipids that have great influence on the activation of NKT cells. The production of IFN-γ increases a lot, you can see the difference between C1 and C34 is huge, and the secretion of IL-4 does not even increase a bit. At the same time, we have found something very interesting, C34 is able to induce more chemokine MCP-1 than the other two antigens.
And if we take a closer look into the ternary complex, the galactose head group is exposed outside, so NKT cells can make contact with glycolipid. We still don’t know why NKT cells would respond differently to lipid chains, since both chains are buried inside CD1d protein. But there is one thing we do know for sure, for a large group like this one, we may found a perfect structure that fits binding pockets. So now most of the new antigens are created based on the structure of C34.
So, this time, we wanna keep using the same lipid chains and do some minor modifications to the galactose head group and see what can we really get. And the crystal structure of the binery and turnery complex has been published, it basically tells us that most of the functional groups are crucial for binding, except 4’-OH and 6’-OH. So we will just focus on these two positions and do nothing to the rest.

這大概就是一半的簡報內容,後面牽涉到未發表的部份,而且由於是化學流程之故,其實講起來很枯燥,所以我的重點多半是將生化背景的流程講得順暢即可,後面的化學流程簡單帶過,而且我也不喜歡講太多廢話,要講得短與順,並以圖片加深聽眾印象,通常不用十分鐘時間就會講完。

2014年2月22日

【Mac】流感病毒複製過程的重新繪製

說來我實在很喜歡將期刊上的圖片簡化並重製,因為原始圖片總是很醜。

比如下圖就是這樣的情形:
一點美感都沒有。
然而其實圖片的繪製法跟先前提過的一樣,只要用簡單圖形進行堆疊,然後稍做調色就會十分漂亮,只是疊到最後一張投影片上會有太多的圖形元件,會使得編輯過程變得十分容易延遲甚至軟體當掉,要控制一下數量才是。

使用軟體,一樣是Mac原廠附贈的Keynote。

最終定稿分鏡圖,主題要突顯,盡量減少不必要的視覺干擾,聽眾才會專心聽你在講什麼。
有兩個mRNA的圖畫錯,上面不應該有NP,懶得再修圖了。

2014年2月15日

【Thoughts】情人節的夜裡,失眠了

自從認識老家在鹿港的新同事阿斌之後,他改變了我蠻多的想法,最近一直催促我去交個女朋友,不禁使我開始思考,人生的下一階段是否該開始動了,而不再是習慣性地一樣一樣來?就在這個特別日子的夜裡,大腦無法放空睡不著(其實是肚子餓了睡不著,吃草莓又不夠飽…-_-|||),只好將想法寫一寫,免得積在腦裡運作。

本人1979年(民國68年)11月18日出生,虛歲35,實歲34,這輩子沒交過女朋友,原因:

1. 父母親糟糕的婚姻狀態造成心理陰影
2. 身體狀況很差,沒那個力氣去想這些事

首先呢,我十分嫌惡自己的父母,雖然他們很愛小孩是沒錯,但是兩個個性極端的人共處一室,腦子卡滿大便不懂得改變做法的行事風格,對我的負擔真的很大。

由於我爸的家庭有五個兄弟兩個姐妹之故,普遍是高中以下學歷,當我爸以高中學歷娶入高職學歷的我媽後,就在傳統農業家庭中受到排擠,他們兩個是1979年9月才結婚,而我是1979年11月出生,誰曉得在懷孕這幾個月內發生過什麼事?我也不想在腦中補完這個過程便是。

我這人講話很直白,就直接講明我爸遺傳到他媽的賤嘴巴,而我媽不曉得是不是遺傳到他爸的潑辣性格,因為外公過世得早,至少我曉得我外婆與阿姨的個性是十分溫柔,壓根覺得我媽應該是醫院抱錯小孩或者領養來的。

總之呢,我媽在許多事的看法與做法是正確的,但不懂得給別人面子,尤其是給男人面子,從大事到小事,諸如刷牙吃飯等的習慣,無一不教訓我爸該怎麼做才是對的,以至於我爸曾經流傳出在公司跟女同事鬧緋聞的事件,打翻我媽的醋譚子,我爸的賤嘴巴則適時補進,兩個人三不五時彼此拿刀互刺,還覺得自己受盡委屈,著實是蠢到不曉得一切都是自找的。

而且自從我懂事後,我媽就不斷地將當年那些婆媳問題與妯娌不合的苦水,全部倒給我去接,我真覺得我媽是他媽的有夠自私,所以我跟爺爺奶奶的關係很差,有一部份原因就是長年來的壓力導致先入為主,當我早認定這兩個人不是什麼好東西時,我自然就會選擇疏遠,就如同我現在對待父母親的方式一樣,說來我還真是有原則的人。(笑)

所以以我怕麻煩的個性來說,有一段時間真的會蠻怕交個女友後會衍生一堆男女之間相處的問題,好比阿斌的女友曾丟過一些奇怪的問題,諸如「你現在是不是有小三啊?」,而阿斌則會不耐煩地回她「對啦對啦,有好幾個」;像我另一位同事阿凱,也是時常在跟老婆吵架,而我跟阿斌得在一旁心理輔導兩個個性十分幼稚的成年人…-_-|||

阿凱每次跟老婆吵架,其實只是為了後續打個轟轟烈烈的一炮來歡喜收場的前戲,真是苦了我,從小到大都在聽這類有完沒完的紛爭。/_\

接著呢,身體部份的問題,就是自小學四年級有印象起,長年在食物極端過敏的情形下,開始不認為自己是個正常人。

可是這一切也是我父母的錯,體質是他們給的之外呢,我媽信奉「家用長子」這套狗屁理論,一直壓迫我要努力向上,他們只覺得我的鼻過敏會這麼嚴重,是因為小時候我拿了一塊棉花往鼻子裡塞,等夾出來時已經沾了很多鼻血,直接將疾病的成因推給小孩子,只為了讓自己心裡好過,但是當我三弟也一樣鼻過敏時,再繼續瞎掰啊?

我父母是自我感覺良好的人,他們曾經凌晨六點把我挖起來送去看中醫,也帶我去試過針灸,總覺得盡了該盡的責任後,就要求我要給相對的表現,又長期處於付出沒有獲得相對回報的狀態,好比國中考試第三名不準打電動,因為我不是第一名,甚至是當我面將全套七龍珠漫畫撕破,這樣的管教方式真的很賤。

所以我深深覺得,我父母毀了我的人生,如果我不是這樣的體質,我也可以跟阿斌一樣身體健康,學業得意,到處交友,甚至女友等,今天就算我是重度過敏體質,他們懂得自我檢討的話,不會逼我去做能力以外的事,以致於累積這麼多年的怨恨,像許多出生就手腳殘缺的人,他們的父母親會覺得自己對不起小孩,不論怎麼做都無法彌補小孩天生條件比不上別人的事實,但我今天就是慘在殘廢得不夠完全,外表像個正常人,所以才會被當正常人要求。

別以為我講這些話是不孝,我當初抱病考上師大研究所以及台大博士班,就是為了讓父母親高興,我媽還自以為是地說這是她管教有方,給的先天條件有夠差,要求還比別人多,罵他們無恥根本太客氣。

自從2012年底發現自己二十年來的病因之後,我就斷了與父母間的聯繫,去年過年沒回去,今年過年也沒回去,以後過年也不會回去,一通電話都沒接過,除了該給的錢會給之外,我著實沒必要再去當個孝子。

就文章架構「起承轉合」來說,我才剛寫完「起」的部份,後面卻不曉得怎麼承接下去了。

我覺得我想講的是,過去二十年真的很糟,雖然現在身體的病近乎完全治好後,腳卻跨不出門了,原因當然是只能靠吃四餐水煮來治過敏的解決之道,在飲食上的不方便,嚴重阻礙我重新投入人群的計劃,如果沒辦法跟別人出去吃喝玩樂,是又怎麼跟別人交朋友,甚至交女友?

我有很多時候,都是自己的水煮便當先吃完,再陪阿斌去吃晚餐,你要是在便當店或快餐店裡看到有個人什麼都不吃不點,只顧著跟旁邊那個啃雞排的人聊天時,那大概就是我了。

我唯一能跟別人吃飯順便聊天的時候,就只有吃燒烤與涮涮鍋,但不可能每天甚至每個星期都去吃一次,而我又很希望可以跟別人聊天,只好陪著他們去吃飯,然後看他們吃著美味香味四溢的食物,心裡有百般的無奈。

過敏治好前與治好後,似乎都免不了要減少與人接觸的機會才可以省下一些不必要的麻煩,以至於我現在都不曉得要怎麼跟人打交道,每每想到要跟別人解釋我為何不能吃,便覺得很累。

不過一個人獨處久了之後,真的蠻羨慕成雙成對的愛侶,就像上班時間我雖然可以跟好友膩在一起講垃圾話,但下了班甚至假日時,他們就要陪女友、老婆與小孩,有自己的生活,我欺騙自己現在跟阿凱與阿斌兩位同事間相處就像大學同學那樣愉快,但每到周末謊言還是會被拆穿,這點其實與大學時期的學生生活頗為不同,至少當學生時,在假日時都還是有同學或朋友陪伴,這也是促使我認真思考交女友的原因之一。

起頭總是難,叫我依循獸性直接在路上跟女孩子要電話這種事大概是辦不到,我不是不敢,我是個很敢演的人,但別人很容易看出來我並不是那種外放個性的人;網路交友其實就更困難了,我對FB這種社群軟體十分排斥,就連本部落格都不開放留言便曉得,網路另一端的人所說的話,對我來說一點也不真實,一個平時話很少的人,可以在部落格寫長篇大論,我也覺得自己在網路上的人格是不真實到了極點。

我是外冷內熱的人,跟我熟的人會認同這點,跟我不熟的人就會覺得我很怪,「為何這人平時不理會我們,但跟某些人卻又特別有話聊」,說來我的個性就是如此極端,一半繼承自我媽的熱情,一半來自我爸的冷感,跟別人交朋友,需要有一定的牽連性,諸如我在工作上不得不與你接觸才能合作,或者我倆彼此有什麼特別相近的背景在共鳴。

好比我最近跟阿凱與阿斌走得很近,就有點像命運相逢,阿凱與阿斌是大學學長與學弟,我跟阿斌是博士班學長與學弟,三個人最後在同一棟大樓工作,而我跟阿凱住附近,自從搭他便車回家後,就多了很多時間了解他與阿斌的背景,三個人的緣份促使我們短短一個月內就變成十分麻吉的朋友,會分享很多心事,當然個性十分合得來才是重點。

說來我是很看重緣份的人,光僅僅是在同一棟大樓工作這樣的條件還不夠,總覺得我跟某些女孩子一樣,會因為「命運的相會」而在腦中過度幻想吧?

如此一來,我唯一能做的,就是透過幾個較常接觸的人來介紹了,不過現在的人際圈真的有夠小。

話說在這沒多少人氣的部落格留下資料會有多少機緣產生?

年齡:34
身高:184
體重:62.5(前面的心得文有貼過照片)
學歷:輔仁大學化學系、師範大學化學所、台灣大學博士班
就職:中研院某中心博士後研究員
興趣:做研究
嗜好:電影配樂、電玩配樂、西洋流行歌曲、電影、電視影集與逐漸遠離的電玩
長相:如右上角頭像所示
專長:除了修理PC以外應該蠻多
運動:目前僅在重訓,天氣回暖會開始慢跑
郵件:d94223025@ntu.edu.tw
住址:新北市中和區
財產:二輪,無房也無四輪,甚至還沒學開車。

2014年2月4日

【Thoughts】筆記數位化

我選擇用Day One這套軟體來當我的數位筆記本軟體,因為介面較簡潔,又可透過iCloud進行Mac/iPad/iPhone的同步,搭配Bamboo Paper在iPad mini上進行繪圖,輸出圖片再透過照片串流上傳回Mac的iPhoto裡面,接著將圖片貼到Day One中,並鍵入文字,我並不想要完全使用iPad app做純手寫的筆記,畢竟打字比較快。

先離題說說自己的想法,之所以想做筆記數位化的原因是,最近被我同事給稍稍打擊到了,也就是鹿港遊一文中提到的那位住鹿港的博士同事。

在我考進台大,看過許多所謂的台灣高材生之後,雖然我自知自己並不是唸書特別強的料,但這些頭腦特別好的人,多半沒比較勤快,做事不見得贏得了我,膽子也不比我大,我敢在股市玩出心得,而且真的賺錢,他們可能很多人連股市都不願意接觸,所以我一直不覺得自己會輸給他們太多,因為我可以透過特異化的路線來贏,直到遇見新同事後,我的想法就稍稍改變了些。

我這新同事的背景實在太有趣,天生體質佳頭腦好,是文武雙全的奇才,國中時幹過流氓,大學時曾經從宿舍四樓摔下來卻沒死,然後推甄上台大碩士班再直升台大博士班,最後當兵的兵種還是海軍陸戰隊,其人生經歷之豐富,是我的十倍,不過我並不是很羨慕他常出事卻死不了的怪命格就是…-_-|||

雖然他平時開口講話就一付鄉下人的腔+流氓樣,但談論起實驗時,卻常讓我佩服不已,看得出來不僅書讀得通,經驗也夠多,才有那能力同時去解決實驗室學弟妹們丟過來的問題,頭腦好又不會瞧不起人,連我都不禁讚嘆此人是人才,在台大七年看過這麼多人,也只會認同這一位而已。

他的表現讓我十分想效仿,以前因為過敏體質之故,對於學習效果或許真的有蠻大的影響,導致我十分抗拒唸書,但現在病治好後,我就很好奇自己是不是也能像他一樣優秀,哪怕只能達成50%的境界,其實也足以滿足我對於研究的熱誠,我就是愛做研究,只要是可以「安全」嘗試的項目,我都不會放棄,一如接下來要寫的內容。
網路購物實在是太方便,按鍵點一點就會止不住的想買,最近就買了:

Goodnotes for iPad: 台幣180元
Noteshelf for iPad: 台幣180元
Day one for Mac: 台幣300元
Adonit Jot Touch 4: 台幣3280元

只為了將筆記數位化。

這裡必須大推PChome 24h這個網站,買3C產品真的送貨快速,如果是早上10點左右下的單,大概下午6點左右就可以收件了。
觸控筆之所以選擇Adonit Jot Touch 4,主要是看它的功能與支援的App還不少,但後來才發現用不到,至少目前用不到。

市面販售的圓頭觸控筆拿來寫筆記是很痛苦的事,那個壓感十分不對勁。
前幾年為了準備博士班資格考,坐在書桌前,一天十二小時,不停地將課本上的重點英譯中,再抄寫到活頁紙上,實在是非常辛苦,當時我真的有記憶困難的問題,唯一想到的方法就是用寫的寫到背起來,我在大四那年準備研究所考試時是如此,我在博士班準備資格考時也是如此,我父母還以為我天生就很會唸書,我的親朋好友也都只看光鮮亮麗的表面,有誰曉得我其實是這樣「解決問題」的?

我不會因為書用唸的唸不下去就不解決這個問題,這疊紙就是我贏過很多人、最後能拿一張台大學歷的證明,這疊不過是2/3的量,還有另一疊待處理,很多東西唸完就忘了,希望可以透過數位筆記的便利性將所有的知識匯整一遍,看將來是否能派上用場。
因為化學筆記需要畫圖的部份很多,個人試過幾套手寫筆記的App後,最中意Bamboo Paper這套軟體,雖然它並不支援我的觸控筆多項功能,不過寫起來的手感挺不錯就夠了。
App提供的付費解鎖功能我都買了,花費的部份當然就不止前述的金額了。
其實說來也很簡潔易用,最後將之輸出成圖片後再貼到Day One上即可。

目前覺得用Day One來整理筆記也不算方便,要是有大量筆記要同時改標籤的話就會稍麻煩一點,一則筆記又只能貼一張圖,雖然最有名的筆記軟體非Evernote莫屬,但用起來不是很習慣。

要是未來有更好的筆記軟體出現,屆時要怎麼搬移就是個大問題了。

【Travel】鹿港遊

這輩子出去玩的次數少得可憐,這十年來,也只有兩次外地開會順便去玩,所以有到訪嘉義中正大學以及日月潭,以前小時候被父母親拖出去走遊,其實根本沒什麼印象,我只記得,不是坐車在睡,就是一直打噴涕流鼻水,根本就不好玩,唯一一次較有印象且悲慘的經驗,就是大年初三與親友們去中橫,結果我們塞在中橫上面16個小時,只能看著遠方霧裡的車燈長龍照亮整條山路。

本次出遊就簡單得多,是我一個人自己去找朋友玩,彰化有一位碩班同學以及一位現任的博士同事,兩個人總是可以約得到一個吧?我就先跟同學約而沒跟同事約,我同學是埔鹽鄉人,我同事是鹿港人,兩個地區只在附近,不過我同事的事情通常比較多,約得到當然就有在地人可以導遊,但也如我所料,他剛好要跟女友下屏東,我只好跟同學去鹿港玩了。
事前買了一本大台中攻略,只是參考一下鹿港有什麼點心是可以當拌手禮的,對我來說,根本就沒一樣敢吃,所以在進鹿港前,我就拖著我同學跟我一起吃涮涮鍋當午餐,這麼做很對不起他,畢竟鹿港真的有太多東西可以吃。

真悲慘,以前身體不好不想出去玩,現在身體治好了,精神好,體力好,卻因為飲食不方便,出去玩也麻煩,以後呢,我乾脆先找家涮涮鍋吃飽再跟朋友約地點,免得又讓他們撐飽肚子看著沿路的小吃卻又沒胃口。
去彰化我是不可能坐火車的,浪費太多時間在坐車上面,能玩的時間就較少,所以我選擇搭高鐵再轉台鐵,而且大年初三訂票不易,商務車廂二話不說就給它訂下去,有送飲料與零食,但我最多也只喝礦泉水…(嘆)

坐高鐵到台中烏日站之後,再走到台鐵新烏日站搭區間車下彰化,結果我訂的是莒光號的座位,18元,其實買區間車的票15元即可,很少坐火車,不太懂怎麼選,一回生二回熟,也才10分鐘時間就可以從新烏日南下到彰化,只是區間車真的超會誤點。
吃完涮涮鍋開始前往鹿港,蠻外圍的部份就有交通管制,我們的車便停在外圍,然後步行前往,基本上以天后宮為中心的這一帶,就像一般的夜市一樣,不過就算是台北夜市,我大概也沒見過有這麼擠的,台灣人雖然曉得每逢假日到處都是人,但還是有很多人會選擇一起去擠個熱鬧,以前我也會覺得人擠人不好玩,但走過一次鹿港後,感覺還不錯,反正我又不需要帶全家大小出遊,一個人玩心裡很放鬆。

我蠻好奇為何這條街上,只有這個區域種了幾顆特別高特別顯眼的樹?等到同事出現後再問問他。
來鹿港當然就要看一下天后宮,我同學問我要不要燒香拜拜,我當然是不肯啊,我覺得我對自己的人生努力付出卻只換得一輩子的詛咒,這世上一定沒有神明吧?

沿路小吃也沒什麼拍照,看了只是心酸而已,來鹿港天后宮附近,說真的只走不吃是玩不久的。
我就買個捏麵人給自己當紀念品了,神明系列一隻200元,有玉皇大帝、關公、觀世音與齊天大聖,沒有媽祖感覺很怪,也許只是我沒看清楚,我買關公不是求保祐,買關公是因為整隻紅,紅色代表過年喜氣啊。
最後帶了三盒餅當拌手禮,不過我事後才想到,對許多人來說過年根本吃太好,再送餅給他們無疑是「無福消瘦」,考慮下次多帶些小小的手工藝品來送人好了,對我來說,當地美食不能吃雖然可惜,但多買一點手工藝品也算是不小的收獲。

我想鹿港會再找時間跑一趟,這次就要請在地人,也就是我同事當導遊。